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hCov-NL63-N Pseudovirus Standard Reference

CBV30018

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I. 背景

hCov-NL63最早是在2004年初在荷兰从一个7个月大的婴儿中从吸出物中分离出来的。此后,HCoV-NL63的感染已被证明是世界范围内普遍存在的疾病,并与许多临床症状有关。诊断包括严重的下呼吸道感染,臀部炎和细支气管炎。HCoV-NL63引起儿童疾病,老年人和免疫功能低下的儿童,在儿童呼吸道感染中占1.0-9.3%

根据CDCWHO的介绍,针对HCoV-NL63的核酸诊断一般是针对RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于对应药物和疫苗的开发。NCBI收录序列为JX504050.1,全长27553bp,基因编码4个结构蛋白:SMNE

以往针对试剂盒检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。

 
II.产品描述

有病毒的完整包膜结构,有HCoV-NL63对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点,非常适合用于核酸诊断性能评价的标准品

构建过程:HCoV-NL63基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测(ddPCR)

 
III. 产品介绍
产品名称: hCov-NL63-N Pseudovirus Standard Reference
对应序列(详情见附录):

Gene N(1134bp)

产品规格: 1ml
拷贝数: >1x10e7copies/ml
生物安全级别: P2
运输与保存方式: 干冰运输,-80°C保存
有效期:  
 
IV. 产品用途与优势
产品用途: HCoV-NL63诊断试剂盒性能评价
产品优势: HCoV-NL63的假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,完美克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;

• 根据HCoV-NL63冠状病毒的特点,选取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合计3个区段的序列,用于假病毒的包装,3个区段很好的表征了HCoV-NL63的特征序列;

• 6163银河线路检测中心生物设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常准确表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性;

• 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法可靠,批次间稳定,可以长期稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。

 
Ⅴ. 附录

Gene N:

ATGGCTAGTGTAAATTGGGCCGATGACAGAGCTGCTAGGAAGAAATTTCCTCCTCCTTCATTTTACATGCCTCTTTTGGTTAGTTCTGATAAGGCACCATATAGGGTCATTCCCAGGAATCTT

GTCCCTATTGGTAAGGGTAATAAAGATGAGCAGATTGGTTATTGGAATGTTCAAGAGCGTTGGCGTATGCGCAGGGGGCAACGTGTTGATTTGCCTCCTAAAGTTCATTTTTATTACCTAGGT

ACTGGACCTCATAAGGACCTTAAATTCAGACAACGTTCTGATGGTGTTGTTTGGGTTGCTAAGGAAGGTGCTAAAACTGTTAATACCAGTCTTGGTAATCGCAAACGTAATCAGAAACCTTTG

GAACCAAAGTTCTCTATTGCTTTGCCTCCAGAGCTCTCTGTTGTTGAGTTTGAGGATCGCTCTAATAACTCATCTCGTGCTAGCAGTCGTTCTTCAACTCGTAACAACTCACGAGACTCTTCT

CGTAGCACTTCAAGACAACAGTCTCGCACTCGTTCTGATTCTAACCAGTCTTCTTCAGATCTTGTTGCTGCTGTTACTTTGGCTTTAAAGAACTTAGGTTTTGATAACCAGTCGAAGTCACCT

AGTTCTTCTGGTACTTCCACTCCTAAGAAACCTAATAAGCCTCTTTCTCAACCCAGGGCTGATAAGCCTTCTCAGTTGAAGAAACCTCGTTGGAAGCGTGTTCCTACCAGAGAGGAAAATGTT

ATTCAGTGCTTTGGTCCTCGTGATTTTAATCACAATATGGGGGATTCAGATCTTGTTCAGAATGGTGTTGATGCCAAAGGTTTTCCACAGCTTGCTGAATTGATTCCTAATCAGGCTGCGTTA

TTCTTTGATAGTGAGGTTAGCACTGATGAAGTGGGTGATAATGTTCAGATTACCTACACCTACAAAATGCTTGTAGCTAAGGATAATAAGAACCTTCCTAAGTTCATTGAGCAGATTAGTGCT

TTTACTAAACCCAGTTCTATCAAAGAAATGCAGTCACAATCATCTCATGTTGCTCAGAACACAGTACTTAATGCTTCTATTCCAGAATCTAAACCATTGGCTGATGATGATTCAGCCATTATA

GAAATTGTCAACGAGGTTTTGCATTAA

 

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